哪个部门负责土地确权

农村耕地所有权确权工作主要由 乡镇人民政府和县级政府负责。具体来说，依据《中华人民共和国农村土地承包法》，村民委员会和乡镇人民政府承担农村耕地所有权的确权工作。在出现纠纷时，当事人可以先协商或请求调解，若无法达成一致或调解不成，可向农村土地承包仲裁机构提起仲裁，或直接向人民法院起诉。

同时，根据《农村土地承包经营权证管理办法》，政府负责颁发承包经营权证，具体工作由农业行政主管部门承担。

此外，县级人民政府登记造册，核发证书，确认所有权。

综合以上信息，可以得出结论：农村耕地所有权确权工作由乡镇人民政府和县级政府负责，具体工作由农业行政主管部门承担，同时涉及多个部门的协作，包括国土资源部门、财政部门、农村工作综合部门、法制工作部门、档案部门等。